Vo februári a v marci 1990 ešte na pôde Národného výboru hlavného mesta SSR po politických rokovaniach došlo k výmene primátora. Stal sa ním kandidát za VPN Roman Hoffbauer. Vo funkcii bol zhruba deväť mesiacov, do prvých slobodných komunálnych volieb v roku 1990.
Na konci roka 1990 na post primátora kandidovalo viacero osobností. Najsilnejšími boli Roman Hoffbauer a Peter Kresánek. V tom roku bola VPN roztrieštená. Kresánka postavila časť VPN – ODÚ. Voľby Peter Kresánek (neskôr KDH) s tesným rozdielom vyhral, vo funkcii primátora zostal dve volebné obdobia. V roku 1994 zvíťazil už s jasným rozdielom.
V roku 1998 mal najsilnejšiu podporu strán DÚ, DS, KDH, SDĽ predseda DÚ Jozef Moravčík. Postupne sa k nemu pridali aj strany SMK a SOP, ktorých kandidáti odstúpili. Politickým protikandidátom Moravčíka bol Július Binder, podporovalo ho zoskupenie okolo HZDS a SNS. Bratislavčania volili pravicovo a politicky, primátorom sa stal Moravčík, na druhom mieste skončil Binder a na treťom mieste nezávislý kandidát, pravicovo orientovaný Peter Beňuška.