Jej väčšia časť bude v tuneli, v meste bude mať tri stanice – Predmestie, Filiálka a Petržalka, ako aj dve zastávky – Nivy a Centrum.
Tunelová trať bude mať asi šesť kilometrov. Pôjde od Predmestia v smere na Filiálku a Šancovú ulicu, potom popod Dunaj, von bude vychádzať za Einsteinovou ulicou neďaleko obchodného domu Átrium.
Tunel bude v hĺbke 16 až 40 metrov pod zemou. Vedenie trate má dva varianty, rozdiel medzi nimi je len v úseku, ktorý vedie centrom mesta. Oba varianty sú situované do blízkosti Národného divadla, pritom jeden – východný, je bližšie k stanici Nivy. Okrem prepojenia Predmestia a Petržalky zahŕňa projekt TEN-T aj elektrifikáciu trate Devínska – Marchegg a spojenie letiska so železničnou sieťou. Stavba sa má začať v roku 2010 a dokončená má byť o päť rokov.
