Po skončení éry trávnatých letísk slúžilo najmä pre zväzarmovský výcvik mladých a akrobatických pilotov. Areál letiska s výmerou 91,15 hektára vložila Slovenská správa letísk v roku 2004 do majetku Letiska M. R. Štefánika v Bratislave, ktoré vajnorské letisko predalo vo verejnom tendri. Správca požiadal Letecký úrad o zrušenie povolenia na prevádzkovanie letiska k 7. februáru 2007.
Nový vlastník, spoločnosť Circle Slovakia v súčasnosti spracúva štúdie na nové alternatívne využitie. Z vajnorského letiska sa stanú s najväčšou pravdepodobnosťou lukratívne stavebné pozemky.
